La villa, commissionata dal capitano Nicolò Zanelli, venne disegnata dall’architetto Gottardo Gussoni, che realizzò qui il suo capolavoro; altre opere a lui attribuibili sono il Villino Raby in corso Francia (dove ritornano, appesantiti e imbarocchiti, alcuni elementi decorativi di villa Zanelli), la palazzata di Corso Francia 65, e la bella casa di Via Duchessa Iolanda 17, sempre a Savona.